89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4526 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
305 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  84.92 
 
 
300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  85.57 
 
 
305 aa  424  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  63.52 
 
 
324 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  59.92 
 
 
325 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  60 
 
 
325 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  64.78 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  54.85 
 
 
246 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  53.04 
 
 
293 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  46.67 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  52.14 
 
 
295 aa  232  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  48.45 
 
 
335 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  48.96 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  52.12 
 
 
262 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  48.72 
 
 
312 aa  215  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  51.24 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  51.64 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  51.72 
 
 
243 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  48.05 
 
 
498 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  45.17 
 
 
399 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  45.14 
 
 
336 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  45.35 
 
 
369 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  48.07 
 
 
299 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
243 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  44.19 
 
 
399 aa  205  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  46.53 
 
 
300 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  46.53 
 
 
300 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  45.9 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  45.49 
 
 
300 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  46.53 
 
 
300 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  45.49 
 
 
300 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  49.33 
 
 
253 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  45.31 
 
 
294 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  47.44 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  49.13 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  49.15 
 
 
301 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  44.68 
 
 
299 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  49.17 
 
 
257 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  47.7 
 
 
255 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  42.92 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  43.03 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  51.07 
 
 
324 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  46.69 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  46.77 
 
 
293 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  49.79 
 
 
320 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  51.68 
 
 
307 aa  168  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  48.1 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  46.06 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  48.21 
 
 
304 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  47.03 
 
 
311 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  43.93 
 
 
312 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  43.93 
 
 
312 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  43.93 
 
 
312 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  50.42 
 
 
319 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  53.19 
 
 
319 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  46.28 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  48.9 
 
 
333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  50 
 
 
298 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  48.66 
 
 
312 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  46.15 
 
 
298 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  49.78 
 
 
321 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  50 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  34.74 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  28.22 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  28.22 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  28.22 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  28.22 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  28.22 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.31 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  27.23 
 
 
254 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  27.61 
 
 
256 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.28 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.55 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  25.49 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  26.34 
 
 
274 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  26.55 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  36.09 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  26.07 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  28.84 
 
 
249 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  26.5 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  26.7 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  27.33 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  24.74 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  29.75 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  26.47 
 
 
255 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  25.93 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  29.51 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>