102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3033 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
319 aa  617  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  66.01 
 
 
319 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  67.43 
 
 
317 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  65.87 
 
 
333 aa  348  7e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  63.26 
 
 
315 aa  335  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  64.58 
 
 
307 aa  331  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  64.71 
 
 
324 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  64.36 
 
 
312 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  61.56 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  53.47 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  58.51 
 
 
320 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  53.93 
 
 
288 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  53.66 
 
 
303 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  49.69 
 
 
312 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  49.69 
 
 
312 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  49.69 
 
 
312 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  47.96 
 
 
300 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  47.65 
 
 
300 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  47.34 
 
 
399 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  47.65 
 
 
399 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  46.71 
 
 
300 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  47.65 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  47.96 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  52.96 
 
 
304 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  51.35 
 
 
299 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  47.02 
 
 
300 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  52.4 
 
 
300 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  52.4 
 
 
336 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  53.29 
 
 
293 aa  262  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  58.96 
 
 
321 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  50.17 
 
 
295 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  51.39 
 
 
311 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  53.66 
 
 
298 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  49.84 
 
 
298 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  44.05 
 
 
299 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  45.08 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  43.57 
 
 
262 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  49.79 
 
 
300 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  39.29 
 
 
258 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  36.25 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  39.15 
 
 
355 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  42.86 
 
 
257 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  41.49 
 
 
324 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  41.49 
 
 
239 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  41.49 
 
 
325 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  44.3 
 
 
255 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  37.86 
 
 
498 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  40.18 
 
 
253 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  37.86 
 
 
293 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.56 
 
 
243 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.42 
 
 
243 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  39.68 
 
 
364 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  49.36 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  41.84 
 
 
325 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  40.27 
 
 
312 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  38.72 
 
 
295 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  53.19 
 
 
305 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  39.08 
 
 
335 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 
250 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  37.6 
 
 
338 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  27.48 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  26.89 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  29.59 
 
 
263 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  30.46 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  31.46 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.99 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.57 
 
 
263 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  25.89 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  29.25 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.48 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  28.17 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.57 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  32.11 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  32.11 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  30.26 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  28.4 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  26.57 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  34.01 
 
 
267 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  27.08 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  30.94 
 
 
255 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  27.94 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  30.87 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  27.96 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  29.23 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.79 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  32.28 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  30.3 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  27.7 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>