115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1272 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
333 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  74.75 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  73.4 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  72.31 
 
 
324 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  71.28 
 
 
312 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  70.83 
 
 
307 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  69.13 
 
 
315 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  65.15 
 
 
319 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  64.42 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  57.14 
 
 
301 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  63.37 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  56.03 
 
 
288 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  54.48 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  55.52 
 
 
303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  57.09 
 
 
293 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  52.6 
 
 
294 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  50.94 
 
 
312 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  50.94 
 
 
312 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  50.94 
 
 
312 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  53.02 
 
 
311 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  54.65 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  50.51 
 
 
300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  50.51 
 
 
300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  54.26 
 
 
399 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  50.51 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  50.51 
 
 
300 aa  272  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  50.51 
 
 
300 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  50.17 
 
 
369 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  58.84 
 
 
321 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  53.85 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  54.26 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  53.88 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  53.74 
 
 
298 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  55.73 
 
 
295 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  52.33 
 
 
298 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  40.48 
 
 
246 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  44.26 
 
 
262 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  42.13 
 
 
258 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  42.69 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  40.73 
 
 
355 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  40.4 
 
 
293 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  48.72 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  44.62 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  40.41 
 
 
250 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  40.49 
 
 
243 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  43.39 
 
 
325 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 
253 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  41.74 
 
 
239 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  41.74 
 
 
324 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  39.27 
 
 
243 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  41.83 
 
 
325 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  44.3 
 
 
255 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  39.92 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 
335 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  41.41 
 
 
312 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  38.02 
 
 
295 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  35.71 
 
 
498 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  48.29 
 
 
305 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  49.57 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  32.54 
 
 
338 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  28.21 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  26.7 
 
 
266 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  30.2 
 
 
310 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.51 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.8 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  31.72 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  27.64 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  29.06 
 
 
266 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  31.19 
 
 
121 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 
268 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.87 
 
 
315 aa  46.2  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  28.21 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.05 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  26.92 
 
 
263 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.1 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  22.08 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.1 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  29.06 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  28.67 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.99 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  28.02 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  21.5 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  29.82 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  31.03 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.16 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  29.06 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  29.82 
 
 
255 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.99 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  27.51 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  25.63 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  28.21 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>