More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1980 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  50.81 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  45.57 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  50.4 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  48.4 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  37.78 
 
 		 299 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  36.96 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  39.74 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  39.74 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  39.74 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  34.5 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  40.77 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  34.09 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  38.89 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  37.99 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  38.49 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  40.57 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.44 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  35.38 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  36.44 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.38 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  43.11 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  38.76 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  32.64 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.17 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.74 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  33.91 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.13 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  37.75 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.54 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  34.21 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  44.21 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  32.6 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  33.62 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  30.67 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  36.96 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.45 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  34.23 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  34.23 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.9 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.75 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.75 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.23 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.23 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.48 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  34.09 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  32.09 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.82 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  26.41 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.23 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  26.41 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.41 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  26.41 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  28.83 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  26.92 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.38 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.87 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  34.29 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.16 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  31.46 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.3 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  24.65 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  34.83 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.04 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  25.84 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  31.36 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  35.45 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  29.5 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.13 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  35.76 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  29.44 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  31.62 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  25.33 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>