More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2679 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  56 
 
 
254 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  53.17 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  57.2 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  51.05 
 
 
265 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  45.16 
 
 
250 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  43.9 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  43.9 
 
 
291 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  41.85 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  40.91 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  43.5 
 
 
299 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  43.9 
 
 
291 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  43.9 
 
 
291 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  43.9 
 
 
291 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  44.31 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  43.61 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  42.24 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  39.91 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  35.88 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  43.25 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  39.3 
 
 
277 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  34.6 
 
 
266 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  36.16 
 
 
266 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  46.46 
 
 
258 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
268 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  34.75 
 
 
267 aa  122  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  43.69 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  33.76 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  38.98 
 
 
282 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39.51 
 
 
255 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 
275 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 
302 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  43.02 
 
 
256 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  35.57 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.48 
 
 
301 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  44.72 
 
 
296 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  47.98 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  39.42 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
275 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.71 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  43.42 
 
 
256 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.52 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 
293 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  38.95 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  39.74 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  38.86 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.68 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  38.86 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  38.86 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  35.1 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38.66 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  37.58 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.94 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  31.67 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  38.73 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  32.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.95 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  43.53 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  34.09 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  34.16 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  37.77 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  33.68 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  34.44 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  34.96 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  34.96 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.38 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  38.19 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  24.26 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.2 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  29.12 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.53 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  30.33 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  33.62 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  34.55 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  35.51 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.53 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  34.84 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  33.62 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  34.68 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  30.59 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  33.91 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  33.08 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  33.99 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  34.25 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  30.04 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  33.88 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.77 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  34.96 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  33.19 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.39 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  36 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.53 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  29.67 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36.57 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>