More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3834 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  467  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  47.35 
 
 
257 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  53.08 
 
 
261 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  50.21 
 
 
259 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  45.58 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  45.58 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  45.58 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  41.59 
 
 
256 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  39.73 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  39.73 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  39.19 
 
 
291 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  39.43 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
291 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  38.39 
 
 
299 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  39.48 
 
 
254 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 
257 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.37 
 
 
291 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  38 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  36.33 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.6 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  33.2 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  30.99 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  32.39 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.43 
 
 
266 aa  92  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.52 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  36.77 
 
 
303 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.27 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.52 
 
 
290 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.77 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  30.25 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  38.43 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.18 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  38.21 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.52 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  37.14 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  31 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  34.71 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  35.81 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  35.86 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  32.77 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  39.01 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  36.05 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  36.82 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  38.75 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.75 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  36.07 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  40 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  35.41 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  35.27 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  36.99 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  35.66 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  35.41 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  33.91 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  36.19 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  33.48 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  35.46 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  39.2 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  33.07 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  33.07 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  33.46 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  36.52 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  33.84 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  37.45 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  33.2 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  33.74 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  31.73 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  36.86 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  32.77 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.76 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  36.86 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  35.89 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  28.86 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  32.13 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.73 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  30.37 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  30.28 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  35.68 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  32.47 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.3 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.8 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  29.03 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.7 
 
 
266 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  38.79 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.7 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>