291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0248 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  61.85 
 
 
267 aa  255  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  36.19 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  27.6 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  26.23 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  26.23 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  31.42 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.53 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  32.29 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.23 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.39 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.39 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  29.48 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  25.6 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  27.76 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  30.8 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  31.1 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  29.67 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  31.1 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.92 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  29.67 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  28.24 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.38 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.56 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0509  hypothetical protein  31.2 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  30.16 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  30.65 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  30.62 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  31.27 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.08 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  28.7 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.66 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.3 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.8 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.92 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  29.09 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.69 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  27.8 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  30.84 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.18 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  29.79 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.23 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  28.24 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.14 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.23 
 
 
291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  28.24 
 
 
277 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  27.35 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  30.8 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  28.1 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  29.92 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.01 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.51 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.2 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  31.95 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.2 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  27.24 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.86 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  27.17 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  28.38 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.68 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  27.24 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  30.9 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  28.45 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.22 
 
 
300 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  27.09 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.72 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  27.43 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.9 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.9 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  29.52 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  24.68 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0578  hypothetical protein  32.57 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  26.79 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  22.41 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.18 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1927  hypothetical protein  32.18 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  27.63 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  28.86 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  32.19 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  31.51 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  26.02 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>