More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5403 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  99.66 
 
 
291 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  88.66 
 
 
291 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  82.82 
 
 
291 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  83.51 
 
 
291 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  60.45 
 
 
303 aa  258  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  57.62 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  64.59 
 
 
292 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  60.71 
 
 
291 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  68.53 
 
 
298 aa  221  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  66.95 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  63.44 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  67.52 
 
 
296 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  45.71 
 
 
254 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  51.97 
 
 
301 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  40.83 
 
 
268 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  39.15 
 
 
266 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 
265 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  55.46 
 
 
256 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  42.92 
 
 
282 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  36.6 
 
 
277 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  36.71 
 
 
267 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  40.48 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  45.33 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  43.42 
 
 
254 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  44.07 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  35 
 
 
268 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  43.22 
 
 
275 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  38.4 
 
 
266 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  39.07 
 
 
252 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.95 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  45.45 
 
 
259 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  41.59 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  43.32 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  39.47 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  39.47 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  39.47 
 
 
257 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  39.74 
 
 
252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  37.34 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  43.51 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  32.08 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  39.57 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  38.16 
 
 
256 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  42.17 
 
 
267 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  41.15 
 
 
254 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  37.34 
 
 
286 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  36.17 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  41.26 
 
 
263 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  39.73 
 
 
252 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  29.26 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  39.59 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  32.81 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  40.54 
 
 
267 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  37.56 
 
 
261 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  42.21 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  33.46 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.03 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  41.56 
 
 
250 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.38 
 
 
270 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  32.42 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  38.58 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  34.29 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  39.18 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  32 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  39.29 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.41 
 
 
2798 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  37.02 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  32.5 
 
 
306 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  33.74 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35.8 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.2 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  32.08 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  34.18 
 
 
272 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  40.22 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  41.34 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  37.64 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  31.67 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  30.46 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  36.45 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  41.11 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  36.72 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  34.85 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  40.1 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.4 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  32.22 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.05 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  38.67 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.96 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>