More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1104 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  51.56 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  53.28 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  51.1 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  51.97 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  51.97 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  51.97 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  51.5 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  51.53 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  50.64 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  53.33 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  50.6 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  43.08 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  42.97 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  32.08 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  49.14 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  36.15 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  46.58 
 
 		 258 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  46.35 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.93 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  30.54 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  36.96 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  39.2 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  43.86 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  38.78 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  51.05 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  30.67 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  38.6 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.12 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  39.34 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  43.81 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.33 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  37.66 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  36 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  34.54 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  35.38 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.87 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.13 
 
 		 2798 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  39.2 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  38.69 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35.09 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.92 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  38.19 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  25.93 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  36.32 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  36.32 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  36.05 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.78 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  36.4 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  33.96 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  41.2 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  29.87 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  32.31 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  30.35 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  37.66 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  32.34 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  42.42 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  41.21 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  40.08 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  45.05 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  30.61 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  36.24 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  39.44 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35.92 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  29.55 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  28.86 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  26.32 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  26.32 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.77 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  34.03 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.1 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  29.15 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  44.44 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  32.31 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  34.88 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  33.62 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  41.61 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.68 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.18 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  36.11 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.36 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  30.08 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.32 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>