274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00086 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  501  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  49.43 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  49.81 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  47.17 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  42.15 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  41.32 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  43.57 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  35.95 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.94 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.54 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.12 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  37.41 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  33.88 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  33.88 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  33.88 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.3 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  34.45 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.25 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.19 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  35.63 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.1 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  34.08 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.81 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 		 302 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.95 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  34.02 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  34.92 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  34.81 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  31.7 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  28.8 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  31.7 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  31.7 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  31.32 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  31.11 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  35.6 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  39.9 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  32.93 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  27.9 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  30.71 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  28.73 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  35.58 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.2 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  29.32 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  33.51 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  31.14 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  30.31 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.35 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  30.31 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.79 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  28.73 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  29.7 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  35.94 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.52 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  28.57 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.1 
 
 		 2798 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  27.68 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.38 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  25.2 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  31.5 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  29.01 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  25.91 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  31.35 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  28.9 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  31.89 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.7 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.37 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  32.67 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25.33 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  24.38 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.33 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25.33 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  29.73 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  27.18 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  31.49 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.33 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  24.89 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  33.19 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  27.44 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.52 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>