230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0673 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  71.8 
 
 
268 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  71.43 
 
 
268 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  70.68 
 
 
268 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  70.68 
 
 
268 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  70.68 
 
 
268 aa  317  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  70.04 
 
 
268 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  70.68 
 
 
268 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  70.68 
 
 
268 aa  314  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  71.09 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  70.31 
 
 
268 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  70.59 
 
 
267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  47.41 
 
 
266 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  44.62 
 
 
268 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  44.53 
 
 
268 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  46.67 
 
 
272 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  46.24 
 
 
273 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  42.32 
 
 
272 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  43.61 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  45.68 
 
 
331 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  40.07 
 
 
269 aa  145  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  45.17 
 
 
273 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 
273 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  44.8 
 
 
285 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  44.7 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  41.2 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  42.34 
 
 
268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  42.47 
 
 
270 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  41.2 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  45.42 
 
 
272 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  45.24 
 
 
272 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  45.2 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  41.84 
 
 
264 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  38.1 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
290 aa  93.2  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.16 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  38.12 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  41.88 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  41.88 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  41.88 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.75 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.11 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  36.48 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  35.11 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.47 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.1 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  37.24 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  34.05 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  34.57 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.1 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  36.73 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.23 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  31.84 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  32.35 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  32.35 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.84 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.12 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.41 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.54 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.43 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  29.82 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.21 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  23.92 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.45 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  33.82 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  33.82 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  33.82 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  34.07 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  32.7 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 
302 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.88 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  34.67 
 
 
308 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  28.45 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  31.79 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  31.65 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.79 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  37.16 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  32.45 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  31.65 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  23.02 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  28.63 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.26 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  32.83 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  25.48 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  29.55 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  32.45 
 
 
316 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.66 
 
 
308 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  30.58 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.21 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.7 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>