More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0266 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
265 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  59.62 
 
 
254 aa  248  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  62.55 
 
 
252 aa  231  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  54.23 
 
 
254 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  47.86 
 
 
250 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  41.53 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  47.26 
 
 
258 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  39.08 
 
 
291 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  50.83 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  44.35 
 
 
257 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  45.1 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  33.58 
 
 
265 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  42.47 
 
 
266 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  44.27 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  44.27 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  42.13 
 
 
291 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  42.13 
 
 
291 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  35.07 
 
 
266 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  39.92 
 
 
268 aa  123  4e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  41.31 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  33.73 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  32.67 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  38.03 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  39.26 
 
 
302 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  43.38 
 
 
298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39 
 
 
255 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  32.54 
 
 
268 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  39.5 
 
 
256 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
271 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  35.68 
 
 
267 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.37 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  35.15 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  37.18 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  39.27 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.52 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  36.75 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  33.08 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  35.5 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.89 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  38.89 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  39.53 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  32.59 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.1 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  36.32 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  36.18 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  35.46 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.98 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.74 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  34.17 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  23.81 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  31.12 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.18 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  23.29 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.6 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  33.96 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  33.71 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33.46 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  34.4 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  31.06 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.82 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.62 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.65 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  34.14 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.71 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  29.31 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  34.44 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  33.71 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  28.29 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  36.86 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  34.11 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  32.38 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  37.95 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  32.38 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  28.96 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.83 
 
 
2798 aa  65.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  34 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.65 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  33.46 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  26.88 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  30.89 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.59 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>