More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2775 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  52.8 
 
 
260 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  49.18 
 
 
271 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  49.8 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  51.08 
 
 
262 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  51.56 
 
 
261 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  49.14 
 
 
259 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  50.62 
 
 
260 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  53.76 
 
 
266 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  47.1 
 
 
267 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  45.52 
 
 
267 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  44.58 
 
 
260 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  46.92 
 
 
267 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  50.99 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  46.15 
 
 
272 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  52 
 
 
260 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  49.42 
 
 
261 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  42.7 
 
 
293 aa  148  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  53.44 
 
 
262 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  45.78 
 
 
257 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  48.25 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  43.91 
 
 
267 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  44.16 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  47.83 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  47.7 
 
 
259 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  49.78 
 
 
261 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  41.07 
 
 
253 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  46.93 
 
 
268 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  47.81 
 
 
268 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  42.02 
 
 
268 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.55 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  39.64 
 
 
288 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  33.63 
 
 
291 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  31.86 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  40.61 
 
 
255 aa  89  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  34.05 
 
 
254 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  37.36 
 
 
257 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.92 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36.92 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36.92 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.68 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.41 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  33.07 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.89 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  40.57 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  40.09 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  33.71 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.25 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  28.84 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.83 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  29.06 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.78 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.78 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.1 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.64 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  36.4 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.36 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  31.51 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  54.63 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  34.31 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.17 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.92 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  28.99 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  31.73 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  31.9 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.58 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  38.57 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  37.28 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31.64 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.94 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  29.55 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  44.66 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  30.56 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30.57 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  46.08 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  30.16 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.36 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.67 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.39 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  34.35 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  31.73 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  32.62 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  31.25 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  29.51 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  29.2 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  26.46 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>