294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1943 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  58.78 
 
 
260 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  54.08 
 
 
259 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  54.09 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  54.86 
 
 
260 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  51.55 
 
 
261 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  50.61 
 
 
286 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  54.51 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  49.01 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  51.91 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  52 
 
 
262 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  41.31 
 
 
261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  44.92 
 
 
267 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  41.31 
 
 
261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 
293 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  49.8 
 
 
261 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  45.34 
 
 
267 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  43.72 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  49 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  43.85 
 
 
266 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  45.45 
 
 
267 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  41.18 
 
 
272 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  48.18 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  38.24 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  45.86 
 
 
253 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
267 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  39.48 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  41.88 
 
 
288 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  41.77 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  43.64 
 
 
268 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  43.62 
 
 
268 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42.56 
 
 
255 aa  100  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  40.78 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  40.78 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  53.28 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.66 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.74 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  32.44 
 
 
303 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  32.16 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.74 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.74 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.1 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  32.81 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.69 
 
 
2798 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  29.18 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  30.53 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  29.65 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.47 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.98 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  29.43 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  29.78 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  31.1 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.81 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.88 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.39 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.47 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.23 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.52 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  27.97 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.96 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.66 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  29.2 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  29.14 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1176  hypothetical protein  27.22 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.463747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.1 
 
 
298 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28.51 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  27.17 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.97 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  37.1 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  25.84 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.51 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  26.91 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.51 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.38 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.38 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  28.51 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.48 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  36 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.96 
 
 
266 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  26 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  32.84 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  28.63 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  28.07 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  32.84 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.05 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  27.78 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  33.33 
 
 
123 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  28.51 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>