More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0360 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
275 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  87.96 
 
 
275 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  49.2 
 
 
277 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  44.3 
 
 
291 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  44.3 
 
 
291 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  44.3 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  46.5 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 
291 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  41.95 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  41.7 
 
 
252 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  44.12 
 
 
291 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  42.42 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 
303 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 
265 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  46.46 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  35.84 
 
 
254 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  36.26 
 
 
250 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  36.84 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  38.71 
 
 
306 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.46 
 
 
255 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.7 
 
 
277 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.9 
 
 
268 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.55 
 
 
301 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  46.55 
 
 
272 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.1 
 
 
266 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  41.9 
 
 
252 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.84 
 
 
268 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  35.97 
 
 
254 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  35.12 
 
 
256 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.85 
 
 
266 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  38.46 
 
 
299 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.64 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  31.51 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  40.89 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
263 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  41.2 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  35.19 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.05 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  36.13 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36.46 
 
 
267 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  34.67 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  35.04 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  35.22 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  35.69 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  35.29 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  26.56 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  36.88 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.02 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  40.71 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  38.74 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  34.57 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  34.68 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  31.27 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  27.01 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  38.98 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  35.79 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.62 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  26.17 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  49.02 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  35.08 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  32.09 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  34.89 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.59 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  33.7 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  36.43 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  36.67 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  33.81 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  31.05 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  36.68 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  33.98 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  34.09 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  34.98 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  37.31 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  32.18 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.27 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.66 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.87 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.27 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  36.55 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.81 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  38.49 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  38.49 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  33.46 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  35.42 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  38.49 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.53 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>