More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  100 
 
 		 272 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  47.5 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  44.98 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  42.44 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  44.08 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  37.04 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.02 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.21 
 
 		 291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.23 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.23 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  36.6 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.57 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.11 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  38.29 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.77 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  32.13 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  37.91 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  36.09 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  35.78 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  30.36 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  36.19 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.33 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  40.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  32.71 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  35.22 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  38.74 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.99 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  37.4 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  30.8 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.14 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  29.76 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.09 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  30.71 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  35.63 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  36.26 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  33.06 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  34.02 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  38.1 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  36.89 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  36.89 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  36.89 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  30.71 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  26.69 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.91 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.77 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  35 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  36.74 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  35.69 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  31.68 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  36.93 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  32.34 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  28.11 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.88 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.28 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  34.23 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  34.94 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  25.77 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  28.87 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  34.59 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  33.86 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  32.01 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  44.55 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  26.21 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  32.21 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.4 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.47 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  31.73 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  29.9 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  28.92 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  31.46 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.02 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  33.83 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  33.58 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  34.94 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  34.57 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>