261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1707 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 273 aa  517  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  96.34 
 
 		 273 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  80.15 
 
 		 273 aa  387  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  62.06 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  64.66 
 
 		 273 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  64.23 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  52.49 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  57.25 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  53.18 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  56.4 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  54.28 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  55.82 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  53.39 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  56.86 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  57.2 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  56.22 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  53.82 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  47.83 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  47.83 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  45.32 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  45.32 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  45.32 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  47.43 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  45.28 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  45.28 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  44.74 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  44.74 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.47 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  44.74 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  46.54 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  42.06 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  41.57 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  34.47 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.77 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.2 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  36.49 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.49 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.87 
 
 		 2798 aa  82.4  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  31.6 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.2 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  33.74 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  32.4 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.08 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  34 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  23.44 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  34.27 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  27.87 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  32.39 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.98 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  29.8 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.8 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  37.95 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  33.64 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  32.32 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.19 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.19 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.19 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  29.85 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.38 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  31.15 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  41.53 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  27.66 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.82 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  32.14 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  29.34 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  30.13 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  30.13 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>