203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2397 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  85.83 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  46.97 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  48.86 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  48.08 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  48.08 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  48.68 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  48.08 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  48.22 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  48.03 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  48.03 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  47.83 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  48.03 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  48.03 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  47.31 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  47.24 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  44.71 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  42.47 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  44.67 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  44.4 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  41.95 
 
 		 267 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  40.23 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  42 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  45.88 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  43.85 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  38.81 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  41.52 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  45.49 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  45.45 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  38.68 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  42.28 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  35.18 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  39.76 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  34.77 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  28.92 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.97 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.03 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  31.51 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  31.51 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  29.29 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.73 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.09 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  31.75 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26.47 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  32.6 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  32.85 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.85 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.85 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  31.82 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  27.14 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.81 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  34.98 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  21.86 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  34.98 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  34.48 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  35.96 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  28.74 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  32.1 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.06 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  26.71 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.48 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.03 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  26.4 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.05 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  26.58 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  28.46 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.13 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  27 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.28 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  27.92 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  24.72 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.65 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.99 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  31.82 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  27.04 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.62 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.71 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.14 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.22 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  28.81 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  32.91 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  33.33 
 
 		 123 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.47 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.5 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>