More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0458 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  88.93 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  83.15 
 
 		 267 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  62.23 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  64.53 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  63.52 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  57.03 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  62.45 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  56.22 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  62.88 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  54.07 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  53.25 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  54.03 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  58.82 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  49.62 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  54.15 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  50.43 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  53.25 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  46.92 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  46.92 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  51.09 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  49.57 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  45.45 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  46.33 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  53.66 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  46.61 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  49.21 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  38.26 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  46.24 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  37.71 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  38.95 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  44.33 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.33 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  35.65 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.9 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.65 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.65 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.65 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  42.73 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.78 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.34 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  41.09 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.67 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.87 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.04 
 
 		 2798 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.17 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  35.34 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  31.01 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.08 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  34.82 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  38.25 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  33.15 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  33.15 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  32.09 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  39.09 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.49 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  36.14 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.43 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  36.56 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.62 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  36.99 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  30.28 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  42.46 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.85 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  27.33 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.22 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  35.09 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.91 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.91 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  39.58 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  28.65 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.04 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.9 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  30.39 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  32.22 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.41 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.65 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  28.44 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  28.23 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.34 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  31.35 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  33.48 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  30.15 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  28.23 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>