292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2579 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
275 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  87.96 
 
 
275 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  44.73 
 
 
291 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  44.73 
 
 
291 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  44.73 
 
 
291 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  46.61 
 
 
277 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  43.91 
 
 
252 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  43.64 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  44.86 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  44.54 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  42.8 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  36.96 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  43.27 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  32.84 
 
 
265 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  36.18 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  44.69 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  35.82 
 
 
250 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39.41 
 
 
255 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  37.08 
 
 
306 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  35.47 
 
 
266 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
252 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.95 
 
 
301 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  36.58 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  33.1 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21290  predicted permease  43.53 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0210962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  35.18 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.46 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  34.3 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  40.77 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  35.79 
 
 
271 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.74 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.58 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  29.5 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  35.66 
 
 
267 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  31.12 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 
293 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  35.79 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  34 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  35.06 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  38.49 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.05 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  34.45 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.87 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.69 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.06 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  38.17 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.89 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.27 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  38.82 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  33.21 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  34.9 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  29.46 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.12 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  36 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  26.91 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.73 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  39.33 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  39.33 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  31.8 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  39.33 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  29.89 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.92 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  32.1 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  35.74 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  36.4 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  31.05 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  34.19 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  31.54 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  38.8 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  32.67 
 
 
354 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.39 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.39 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.29 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  34.53 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  38.43 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  33.95 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  37.4 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  36.03 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  27.83 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  48.98 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  34.34 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.56 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  38.63 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  29.79 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.91 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  30.49 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  31.25 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  24.13 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>