More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0174 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  57.09 
 
 
252 aa  218  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  51.9 
 
 
265 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  48.41 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  45.22 
 
 
291 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  41.59 
 
 
299 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  53.17 
 
 
267 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  44.67 
 
 
291 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  44.67 
 
 
291 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  41.15 
 
 
268 aa  155  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  45.08 
 
 
291 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  45.08 
 
 
291 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  45.08 
 
 
291 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  41.74 
 
 
303 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  45.49 
 
 
291 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  42.06 
 
 
257 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  39.85 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  39.39 
 
 
266 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  39.74 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.73 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  35.12 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  41.2 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  43.6 
 
 
298 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  34.44 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  40.08 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  32.95 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  40.16 
 
 
255 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  35.15 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  40.52 
 
 
256 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  43.98 
 
 
296 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
302 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
271 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  39.3 
 
 
292 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.6 
 
 
301 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  33.59 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  31.38 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  33.46 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  32.93 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.39 
 
 
275 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  38.41 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  30.86 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  37.75 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  33.47 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.77 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.04 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  39.07 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.16 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  32.29 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  32.33 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  40.54 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  32.9 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  33.21 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  34.2 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  34.2 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  30.51 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  27.62 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  32.92 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  32.05 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  32.76 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.68 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  27.76 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.97 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  31.78 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  35.34 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  32.93 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  35.74 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.67 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  36 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  36.82 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  32.63 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0765  hypothetical protein  34.04 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  33.2 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  30.11 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.93 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  30.86 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  31.76 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  35.75 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  34.91 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  30.49 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  27.51 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  28.99 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  37.2 
 
 
269 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3924  hypothetical protein  25.52 
 
 
255 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  0.316412 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  25.53 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.28 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  28.7 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>