26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3924 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3924  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  0.316412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  27.06 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  26.38 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01124  hypothetical protein  24.28 
 
 
302 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  22.09 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  22.86 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  24.56 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  25.61 
 
 
271 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.62 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  23.69 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  23.66 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  24.44 
 
 
299 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  22.96 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  23.9 
 
 
300 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  26.41 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  23.25 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  23.53 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  27.27 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  20.91 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  23 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  23 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  29.91 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  23.01 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  24.22 
 
 
255 aa  42  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  23 
 
 
291 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  24.26 
 
 
254 aa  42  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>