More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1048 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  486  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  29.81 
 
 
242 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.68 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.36 
 
 
2798 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  28.85 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.18 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  29.35 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.15 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.55 
 
 
307 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.31 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  26.81 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  25.62 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.64 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.3 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  26.02 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  26.12 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.92 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.48 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  27.23 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.17 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  29.81 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.73 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  29.73 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  29.81 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  23.98 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  22.83 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  29.17 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  23.21 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  26.34 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  23.4 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  24.71 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  23.24 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  23.05 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  23.97 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  27.82 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  24.47 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  24.26 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  25.71 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  22.13 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3924  hypothetical protein  26.38 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  0.316412 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  28.43 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  23.97 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  28.43 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  26.27 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  32.28 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  22.49 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  23.95 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1742  hypothetical protein  30.96 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0319793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  22.49 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.21 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  30.85 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  23.17 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  22.4 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  33.08 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  29.04 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  23.87 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  22 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  22 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  22 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  22 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  25.56 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  23.43 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  23.73 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  25.09 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  25.53 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  26.97 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  26.05 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  26.72 
 
 
332 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  22.98 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  22.98 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  25.73 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  26.72 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.67 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  22.71 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1176  hypothetical protein  28.51 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.463747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  23.21 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  25.54 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  22.71 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  25.93 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.19 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  22.98 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.57 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  22.71 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>