198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  100 
 
 
302 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  52.73 
 
 
302 aa  242  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  46.42 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.14 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
415 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  34.82 
 
 
121 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.5 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.4 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.8 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  24.01 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.47 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  26.69 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  27.46 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.09 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  26.72 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  28.21 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  25.83 
 
 
443 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.5 
 
 
119 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  24.91 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.14 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.11 
 
 
2798 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  36.97 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.53 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.26 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  29.97 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  27.08 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  25.68 
 
 
269 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  26.42 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.27 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.93 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.01 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  28.62 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  26.9 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.84 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  26.58 
 
 
427 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  28.47 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  26.49 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.49 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  32.76 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  32.17 
 
 
285 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  27.24 
 
 
266 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  25.17 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  25.69 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  22.59 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  26.3 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  35.21 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  24.63 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  36.7 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.75 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  29.89 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  24.68 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  27.23 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  26.59 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  28.62 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  26.59 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  30.2 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  24.75 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  24.81 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  32.82 
 
 
254 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  29.97 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  26.89 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  33.06 
 
 
255 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.61 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.2 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  23.26 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  23.61 
 
 
415 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  25.26 
 
 
426 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  25.56 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  24.81 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  24.44 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  50.88 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  24.85 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  23.68 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  33.04 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.61 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  25.76 
 
 
251 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>