More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1576 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  65.07 
 
 
260 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  60.78 
 
 
258 aa  265  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  55.42 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  59.84 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  63.43 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  54.26 
 
 
258 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  37.6 
 
 
2798 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  34.23 
 
 
266 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  92  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  34.23 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  34.38 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  34.38 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  32.71 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  30.62 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  30.29 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  32.26 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  31.37 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  31 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  42.5 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  43.12 
 
 
121 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  31.46 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  39.22 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  32.78 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  32.78 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.53 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.96 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  45.36 
 
 
119 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  29.01 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  28.52 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.73 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.41 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.41 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  39.45 
 
 
121 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  32.92 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.64 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  27.19 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  35.78 
 
 
131 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.61 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.97 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  32.66 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.15 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.36 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  27.19 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  33.01 
 
 
117 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  33.12 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  36.75 
 
 
125 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  34.31 
 
 
120 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.73 
 
 
303 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  27.19 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  58.5  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  44.76 
 
 
120 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.81 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  29.43 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  27.53 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  29.3 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  29.02 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  29.68 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  28.18 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  30.62 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  30.59 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.17 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  25.12 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  30 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  25.6 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  32.09 
 
 
299 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  34.55 
 
 
302 aa  56.2  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  26.73 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  28.91 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.12 
 
 
268 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4952  protein of unknown function DUF81  33.68 
 
 
262 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  26.05 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.12 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  36.46 
 
 
346 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  31.84 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.69 
 
 
123 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  38.37 
 
 
122 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.4 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  36.19 
 
 
127 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  23.69 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.8 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  36.04 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  40.54 
 
 
121 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  37.63 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>