168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1991 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  69.42 
 
 
121 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  67.77 
 
 
121 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  73.55 
 
 
121 aa  149  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  63.64 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  68.97 
 
 
116 aa  124  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  49.58 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  48.36 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  41.03 
 
 
255 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  42.24 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  49.46 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  39.45 
 
 
251 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  38.68 
 
 
2798 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  45.69 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  37.84 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  41.03 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  43.84 
 
 
269 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  34.82 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  37.01 
 
 
260 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  37.69 
 
 
260 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  55.05 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  36.92 
 
 
260 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  36.92 
 
 
260 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  40.24 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  36.15 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  36.84 
 
 
260 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
258 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  38.89 
 
 
263 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  34.17 
 
 
117 aa  57.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  35.61 
 
 
260 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  39.09 
 
 
254 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 
254 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 
285 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  38.68 
 
 
255 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  35.61 
 
 
267 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
286 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  31.53 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  36.67 
 
 
286 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  37.5 
 
 
244 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  35.2 
 
 
270 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  35.34 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
302 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  34.82 
 
 
267 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
270 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  34.21 
 
 
304 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  34.45 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  31.58 
 
 
243 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  42.31 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  33.08 
 
 
263 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.73 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 
254 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  35.65 
 
 
276 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.94 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  33.65 
 
 
261 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  33.65 
 
 
261 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  33.65 
 
 
249 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  29.46 
 
 
303 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  32.67 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  34.38 
 
 
273 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  32.41 
 
 
249 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  32.2 
 
 
270 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  31.3 
 
 
266 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 
270 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  32.77 
 
 
247 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  36.19 
 
 
260 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  36.19 
 
 
260 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  31.78 
 
 
261 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  32.8 
 
 
268 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  36.44 
 
 
294 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  29.25 
 
 
261 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  31.13 
 
 
302 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  35.71 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  32.11 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1447  hypothetical protein  40.83 
 
 
118 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  30.17 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  30.17 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  28.3 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  32.43 
 
 
304 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  30.71 
 
 
241 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  40.28 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  30.17 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  29.92 
 
 
241 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  31.46 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  31.46 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  28.3 
 
 
261 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  30.17 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  30.4 
 
 
268 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  31.86 
 
 
265 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>