176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0341 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  455  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  65.87 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  60.93 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.53 
 
 		 2798 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  31.5 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  31.62 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  32.59 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.1 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  32.61 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  30.49 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.71 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1901  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.407274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.1 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.1 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.18 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.31 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.12 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  32.02 
 
 		 294 aa  62  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.9 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  29.61 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  35.05 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  35.33 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  34.07 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.2 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25.89 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  31.28 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.89 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  29.15 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.2 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  25.89 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  27.97 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  28.35 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.44 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  36 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.58 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  40.38 
 
 		 121 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.65 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.8 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.8 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.74 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  31.09 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  37.11 
 
 		 121 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  23.88 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.39 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  32.11 
 
 		 117 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  31.16 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.84 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  28.63 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  30.22 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  39.13 
 
 		 269 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  33.66 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  26.48 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  33.9 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.72 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  32.23 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  32.08 
 
 		 123 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  24.46 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  29.23 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  32.2 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  31.11 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  24.23 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  28.43 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  25.81 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  32 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2182  protein of unknown function DUF81  22.33 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000194994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  28.3 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  31.68 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>