144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0425 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  78.51 
 
 
121 aa  186  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  67.77 
 
 
121 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  72.73 
 
 
123 aa  143  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  67.77 
 
 
121 aa  140  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  74.14 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  51.38 
 
 
120 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  43.43 
 
 
2798 aa  82.8  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  43.44 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  44.09 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  43.12 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  38.46 
 
 
255 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  39.5 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  40.22 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  44.79 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  38.71 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  50.46 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  34.45 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  37.3 
 
 
260 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 
258 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  35.71 
 
 
260 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  39.45 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  38.18 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  29.41 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  37.3 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  35.71 
 
 
260 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 
254 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  35.71 
 
 
260 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  33.59 
 
 
260 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  37.11 
 
 
244 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.59 
 
 
267 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  34.19 
 
 
265 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  39 
 
 
259 aa  51.6  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  34.51 
 
 
260 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  30.97 
 
 
285 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  33 
 
 
286 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  32.28 
 
 
269 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  33.94 
 
 
243 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  33.07 
 
 
268 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  34.65 
 
 
254 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  32.17 
 
 
257 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  37.04 
 
 
263 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
270 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  33.07 
 
 
270 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  37.27 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  35.79 
 
 
286 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  42.11 
 
 
260 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.97 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  36.04 
 
 
265 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  35.92 
 
 
244 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  32.41 
 
 
312 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.04 
 
 
276 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  30.83 
 
 
302 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  30.71 
 
 
270 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  34 
 
 
260 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  34 
 
 
260 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  35.65 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  52.17 
 
 
251 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.43 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  36.46 
 
 
302 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
268 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 
250 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  31.91 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  34.15 
 
 
249 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  33.94 
 
 
255 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
267 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  32.43 
 
 
268 aa  45.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  35.64 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  33.08 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  35.64 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4055  hypothetical protein  35.23 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.588545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  32.95 
 
 
662 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  38.46 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  32.03 
 
 
298 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  32.69 
 
 
254 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  34.82 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  27.62 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  29.31 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 
300 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.07 
 
 
268 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  37.21 
 
 
282 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1214  hypothetical protein  34.78 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  32.11 
 
 
249 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  31.5 
 
 
263 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  33.63 
 
 
277 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  32.14 
 
 
254 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  33.62 
 
 
275 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  32.11 
 
 
261 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  44.23 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>