203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2540 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2540  permease  100 
 
 		 123 aa  245  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  66.09 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1447  hypothetical protein  54.29 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  36.28 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  37.29 
 
 		 255 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  35.09 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.81 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  38.32 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.93 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  36.75 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5038  hypothetical protein  43.12 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.337261  normal  0.113634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  33.03 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  35.25 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  35.71 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.61 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0263  protein of unknown function DUF81  36.7 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.558551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  35.35 
 
 		 293 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.17 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  34.15 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.71 
 
 		 260 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  34.26 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.13 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  33.03 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  32.14 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  31.71 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  31.71 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  29.91 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  33.03 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  37.96 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.63 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  35.29 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  33.03 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  41.07 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  33.94 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  32.46 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  31.78 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  29.91 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  32.23 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  30.89 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  30.89 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  30.89 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  30.89 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  30.7 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  30.89 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 291 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  33.02 
 
 		 244 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  32.2 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1707  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492848 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.37 
 
 		 270 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  34.78 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.36 
 
 		 251 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2026  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.24 
 
 		 270 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0656  protein of unknown function DUF81  31 
 
 		 266 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  33.33 
 
 		 2798 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  30.84 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.58 
 
 		 306 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  29.27 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 		 260 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 		 260 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  36.52 
 
 		 269 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 		 257 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  31.93 
 
 		 315 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  32.5 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.67 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1485  hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.156488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  28 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  32.5 
 
 		 260 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1422  hypothetical membrane spanning protein  31.58 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.63 
 
 		 263 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  33.06 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  31.86 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  27.52 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  32.08 
 
 		 283 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  32.5 
 
 		 260 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  33.64 
 
 		 304 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  31.96 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  32.17 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  35.24 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  32.08 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  30.39 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>