33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2721 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  40.41 
 
 
265 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  36.24 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  36.24 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  39.24 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  39.24 
 
 
282 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  37.55 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  34.1 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  37.29 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  38.82 
 
 
275 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  35.15 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  44 
 
 
662 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  25.94 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  37.27 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  24.25 
 
 
2798 aa  55.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  25.14 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  24.72 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.96 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.96 
 
 
289 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  22.29 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  27.27 
 
 
123 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.67 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.5 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.5 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  36.14 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  27 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  33.05 
 
 
123 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  37.23 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>