44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4078 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 261 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  72.76 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  72.22 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  71.24 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  63.83 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  65.53 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  65.13 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  61.75 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  48.06 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  47.26 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  47.26 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  65.44 
 
 		 662 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  62.99 
 
 		 211 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.35 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.25 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.94 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.51 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  28.69 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  32.5 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  32.5 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.59 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  31.28 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  26.46 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.01 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  32.29 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  36.56 
 
 		 121 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  28.77 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.34 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.34 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  26.09 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  32.93 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  31.06 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.86 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  30.16 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  45.9 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  25.76 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.21 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.22 
 
 		 260 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.22 
 
 		 260 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>