59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4428 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
267 aa  510  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
267 aa  510  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  81.01 
 
 
265 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  44.23 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  47.64 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  42.86 
 
 
276 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  41.6 
 
 
262 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  44.54 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  40.61 
 
 
275 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  43.16 
 
 
339 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 
262 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  36.25 
 
 
287 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  56.7 
 
 
108 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  47.46 
 
 
662 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  42.86 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.91 
 
 
2798 aa  62.4  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  24.47 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.8 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  24.86 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  23.63 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  27.7 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  33 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.91 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  23.04 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.94 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  26.29 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  31.01 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.94 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.65 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.91 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.81 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.7 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.81 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  34.02 
 
 
121 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.38 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  28.08 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.14 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.96 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.96 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  24.22 
 
 
317 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  27.05 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.06 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  28.43 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  26.64 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  27.13 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  23.66 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  27.33 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  22.73 
 
 
123 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  29.66 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  29.66 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  32.95 
 
 
242 aa  42.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  29.13 
 
 
249 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 
309 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  29.84 
 
 
286 aa  42  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.84 
 
 
289 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  29.66 
 
 
249 aa  42  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>