183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0357 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  229  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  78.51 
 
 		 121 aa  186  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  69.42 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  75.21 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1723  hypothetical protein  78.45 
 
 		 116 aa  141  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.151499  normal  0.172304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1785  hypothetical protein  66.12 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0399073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  49.14 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  48.76 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6948  hypothetical protein  49.47 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  40 
 
 		 2798 aa  73.6  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  42.5 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  40.17 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3774  hypothetical protein  44.83 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  40.34 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  44.25 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  39.47 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4611  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.246748  normal  0.76013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  42.68 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 		 286 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  35.14 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1033  hypothetical protein  55.05 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.879538  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  36.51 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  37.93 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  39.83 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  35.45 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  34.55 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  38.89 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  31.58 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  43.59 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  34.92 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.91 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35.9 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  40.38 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  36.61 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  36.52 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  41.51 
 
 		 286 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.59 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  35.71 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  34.86 
 
 		 267 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  34.78 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  37 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  32.77 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  33.04 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  34.48 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  34.95 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  34.48 
 
 		 662 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  43.42 
 
 		 260 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.38 
 
 		 270 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  33.61 
 
 		 294 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4234  protein of unknown function DUF81  31.5 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  30.25 
 
 		 251 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 		 285 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  40.83 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  36.94 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  34.62 
 
 		 273 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  34.17 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.9 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  33.59 
 
 		 298 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  35.71 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  32.17 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  38.3 
 
 		 302 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  34.88 
 
 		 274 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  31.5 
 
 		 268 aa  48.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.86 
 
 		 268 aa  48.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  36.27 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  36.27 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  36.27 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  31.93 
 
 		 265 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  35.64 
 
 		 268 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  35.4 
 
 		 262 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.57 
 
 		 306 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  36.56 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 		 312 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  32.76 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  36.17 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  36.63 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  36.63 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  36.63 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  34.21 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>