180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04702 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  77.33 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  77.33 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  60.7 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  60.38 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  57.73 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  56.82 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  53.28 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  55.65 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  44.98 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  43.72 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  45 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  43.41 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  43.29 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  41.28 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  43.06 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  43.05 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  42.6 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  47.95 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  47.13 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  36.68 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  34.25 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  32.73 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  34.02 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  34.15 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.29 
 
 		 2798 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  30.94 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  28.32 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  30.22 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.83 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  31.35 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.91 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  32.55 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.82 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.82 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.09 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.9 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.94 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  29.35 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25.13 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.04 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25.96 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  25.57 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.14 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.13 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  25.57 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.05 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  25.13 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.76 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.64 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  23.04 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.78 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  26.55 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.79 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.61 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.53 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  27.62 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32.35 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  35.92 
 
 		 120 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  40.19 
 
 		 120 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  30.2 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  24.42 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.09 
 
 		 117 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  29.89 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  26.12 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.07 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  21.92 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  27.07 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  31.37 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  26.41 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>