224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5106 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  87.84 
 
 		 277 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  55.26 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  52.97 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  53.18 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  50.47 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 286 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  48.19 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  49.77 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  48.19 
 
 		 261 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  47.97 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  47.56 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  48.8 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  44.91 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  45.95 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  47.12 
 
 		 249 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  50.96 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  44.59 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  32.16 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  31.22 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  33.01 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  21.93 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.28 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  25.14 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.92 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  31.25 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.8 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.87 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.15 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  23.67 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  25.23 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  34.21 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  23.97 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  39.64 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  23.14 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.47 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  27.67 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.17 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.24 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.24 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  29.18 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  33.94 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  21.4 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  23.55 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1450  hypothetical protein  25.53 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  22.31 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  34.95 
 
 		 117 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.71 
 
 		 2798 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.52 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  23.61 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  21.95 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  30.25 
 
 		 120 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  33.86 
 
 		 123 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  26.67 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  26.59 
 
 		 268 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.53 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.08 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  30.69 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.55 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.55 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.78 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  24.51 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  28.57 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  28.46 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  31.46 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  27.88 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  26.22 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  35.61 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  31.79 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  34.85 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  26.59 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  35.61 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>