269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  96.79 
 
 		 249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  65.31 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  64.49 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  64.9 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  64.9 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  62.84 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  62.56 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  65.71 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  61.54 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  47.66 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  50.67 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  47.8 
 
 		 286 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  49.06 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  44.13 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  44.93 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  43.95 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  43.95 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  49.55 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  40.91 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  32.16 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.73 
 
 		 2798 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.5 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.87 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  30.5 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.57 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.17 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.57 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  30.25 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  26.59 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.73 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.99 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  29.63 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.25 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  25.83 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.28 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  34.78 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.22 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.57 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.96 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.4 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.91 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  29.55 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.61 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.08 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  25.83 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  24.53 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  23.99 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.08 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  25.4 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  25.4 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  26.59 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.83 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  26.48 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  29.81 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.53 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.23 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  43.24 
 
 		 119 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  22.49 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  24.9 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  27.8 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.27 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.5 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  29 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  27.31 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.36 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  23.79 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  31.5 
 
 		 125 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.2 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  29.23 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  32.48 
 
 		 119 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  23.6 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  23.6 
 
 		 296 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  24.67 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  27.75 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  19.49 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  28.52 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.55 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>