190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5171 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
265 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  52.45 
 
 
266 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  51.5 
 
 
277 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  50.57 
 
 
267 aa  237  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  44.96 
 
 
268 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  45.15 
 
 
268 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  39.02 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  42.19 
 
 
261 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.71 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.71 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.71 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  38.87 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.24 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  36.13 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  36.4 
 
 
291 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.89 
 
 
257 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.9 
 
 
299 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.5 
 
 
250 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  39.09 
 
 
258 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  35.02 
 
 
303 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.43 
 
 
301 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  33.86 
 
 
255 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  38.59 
 
 
256 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.65 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 
252 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 
302 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  33.58 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  30.86 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  35.89 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  35.25 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.67 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  30.67 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  28.03 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  27.66 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  32.33 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  31.18 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  28.97 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30.34 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  29.09 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30.65 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  32.48 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  27.92 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  31.06 
 
 
276 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  30.41 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  32.13 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  29.17 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  35.47 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  28.22 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  28.79 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  26.49 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  29.96 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  26.45 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  28.28 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  24.91 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  29.57 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  29.57 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  28.85 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  29 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  23.5 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  29.24 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.32 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  30.26 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.3 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  29.59 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  27.14 
 
 
272 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  30.7 
 
 
257 aa  52  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 
265 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  29.51 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  31.46 
 
 
306 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  29.24 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>