210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0798 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  62.55 
 
 
272 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  52.04 
 
 
273 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  52.09 
 
 
273 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  51.87 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  63.86 
 
 
254 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  49.25 
 
 
273 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  45.49 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  45.69 
 
 
270 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  47.02 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  46.82 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  44.27 
 
 
285 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  46.12 
 
 
272 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  43.36 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  44.94 
 
 
272 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  48 
 
 
276 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  44.66 
 
 
272 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  41.26 
 
 
268 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  41.26 
 
 
268 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  41.26 
 
 
268 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  41.04 
 
 
268 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  41.04 
 
 
268 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  41.11 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  42.75 
 
 
268 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  41.26 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  42.35 
 
 
268 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  42.52 
 
 
267 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.55 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  41.22 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  37.19 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  36.97 
 
 
268 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  38.2 
 
 
266 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  36.84 
 
 
268 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.67 
 
 
2798 aa  89.4  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  34.89 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.09 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.96 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  30.59 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  29.95 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.34 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.05 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.05 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  28.52 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  26.64 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  27.05 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.75 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.18 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  26.42 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  30.04 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.68 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  27.71 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  25.69 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  36.11 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.11 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.11 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.86 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.11 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  27.31 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  26.94 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  28.69 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  28.69 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25.86 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  27.43 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  26.52 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  29.59 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.99 
 
 
315 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  22.57 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  23.81 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  31.25 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.97 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  32.08 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  28.96 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  28.09 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.78 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  28.05 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  24.7 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.89 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.19 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>