246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12623 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  501  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  74.14 
 
 
266 aa  363  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  57.68 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  50.57 
 
 
265 aa  275  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  53.56 
 
 
268 aa  258  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  53.31 
 
 
268 aa  256  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  50.57 
 
 
266 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.92 
 
 
291 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.92 
 
 
291 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  37.97 
 
 
291 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  40.08 
 
 
291 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  37.97 
 
 
291 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  39.24 
 
 
291 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.86 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  39.92 
 
 
254 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.33 
 
 
299 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.67 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  38 
 
 
302 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  35.1 
 
 
282 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  30.58 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  36.1 
 
 
256 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  31.73 
 
 
266 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  36.19 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  40.16 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  33.76 
 
 
252 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  34.98 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
252 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  35.54 
 
 
254 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  32.78 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  33.94 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.64 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  25.93 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  29.55 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  22.43 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  34.75 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  22.43 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  23.46 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  28.52 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  30.83 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  30.89 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  28.25 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  29.84 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  30.22 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  27.31 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  30.04 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  26.34 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.34 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  26.07 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  25.19 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  23.53 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.86 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.94 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  29.81 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  28.68 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.02 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2645  protein of unknown function DUF81  25.84 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000890995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  34.63 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  29.81 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  25.91 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  25.91 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  25.65 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  24.76 
 
 
246 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  25.65 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  26.6 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  26.6 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.43 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.43 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  30.8 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  29.48 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  23.49 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  30.21 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  25.55 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  27.24 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  31.21 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.82 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  30.64 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  24.64 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  42.35 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  23.7 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  42.35 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.27 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  24.02 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.77 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>