More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0935 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  480  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  55.84 
 
 
282 aa  211  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  50.86 
 
 
302 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  42.06 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  41.11 
 
 
266 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  41.3 
 
 
299 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  41.56 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  36.44 
 
 
268 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  31.82 
 
 
266 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  34.44 
 
 
277 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  40.79 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.89 
 
 
291 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  39.91 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.28 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  35.97 
 
 
250 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  40.77 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  43.46 
 
 
298 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  40.87 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  31.91 
 
 
267 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  36.64 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  39.29 
 
 
255 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  38.79 
 
 
301 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.33 
 
 
266 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.98 
 
 
275 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  39.26 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 
275 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  43.19 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  30.45 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  30.89 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  34.2 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  32.41 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.65 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  27.53 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.22 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.02 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  36.89 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  31.62 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  37.55 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.3 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  28.99 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.2 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  38.84 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.03 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32.33 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.41 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.17 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  31.92 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.12 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.17 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  26.21 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.12 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  33.73 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  37.08 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  33.19 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.12 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  32.6 
 
 
331 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  30.26 
 
 
274 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  29.74 
 
 
255 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  27.64 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  29.57 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  32.13 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  32.3 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  32.3 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  32.91 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  28.1 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  30.15 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  29.79 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  37.08 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  29.72 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  29.84 
 
 
277 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.85 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  52.63 
 
 
296 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  35.96 
 
 
267 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 
268 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  30.51 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  36.7 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  29.17 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.11 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  29.84 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.42 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>