More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3745 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  63.24 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  64.23 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  66.54 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  60.38 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  66.8 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  60.56 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  58.96 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  55.74 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  52.92 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  59.14 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  56.96 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  59.45 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  51.18 
 
 		 272 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  52.59 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  58.19 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  52 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  54.32 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  51.48 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  57.83 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  57.21 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  57.21 
 
 		 268 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  53.44 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  53.44 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  56.33 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  48.7 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  52.11 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  43.17 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  48.84 
 
 		 266 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  42.34 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  37.78 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  46.83 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  43.77 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  46.83 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.38 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  38.29 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  33.88 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  31.86 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.93 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  34.51 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  39.55 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  34.5 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  32.95 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  32.95 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  32.02 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.19 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  53.06 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  34.48 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.16 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  34.2 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.16 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.37 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  29.96 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  28.99 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.69 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.16 
 
 		 2798 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  34.67 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  34.67 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  34.67 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  29.87 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.66 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  31.09 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  38.57 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  31.11 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  32.14 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  27.37 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  33.08 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  34.36 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  29.08 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  23.24 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  29.18 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  32.14 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  27.37 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  26.41 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  31.7 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  32.08 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.37 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  28.27 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  34.53 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.05 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  36.69 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  26.7 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  28.91 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.42 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.76 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>