More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3835 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  96.92 
 
 		 260 aa  390  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  65.5 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  62.13 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  63.92 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  58.89 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  57.31 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  59 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  50.58 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  56.96 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  54.88 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  54.07 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  60.56 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  54.07 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  57.81 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  55.16 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  53.91 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  59.49 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  53.11 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  58.7 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  52.9 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  50 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  57.27 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  55.95 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  42.96 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  53.39 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  52.63 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  50 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  44.7 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  45.22 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  38.31 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  46.77 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  42.06 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  42.06 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  42.06 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  36.51 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  37.76 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  55.83 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  37.34 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  43.3 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.65 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  35.34 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  36.76 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  30.84 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.59 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.78 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  40.1 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.9 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  31.88 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  36.28 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.58 
 
 		 2798 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.66 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  29.27 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31.89 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  26.74 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  34.47 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  31.89 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  29.66 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  35.2 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  29.96 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  39.21 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  32.49 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  33.82 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.55 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.55 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.42 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  30.74 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.75 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.35 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.23 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.72 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.16 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  32.26 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.27 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  30.53 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  32.18 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.37 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  28.4 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.73 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.85 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  30.57 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  29.34 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  31.87 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  31.68 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  28.3 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>