More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2067 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2067  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  546  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  61.3 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  52.11 
 
 
276 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  47.62 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  41.9 
 
 
271 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0051  hypothetical protein  42.91 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0510  hypothetical protein  43.54 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.463759  normal  0.0191115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1470  hypothetical protein  44.74 
 
 
256 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  42.28 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2640  protein of unknown function DUF81  44.6 
 
 
266 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  41.88 
 
 
260 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  43.43 
 
 
260 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  46.01 
 
 
261 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  42.17 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  36.46 
 
 
267 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  43.75 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  39.23 
 
 
267 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1999  hypothetical protein  41.9 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  40.78 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1919  hypothetical protein  41.34 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  39.58 
 
 
261 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  40.81 
 
 
272 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  39.58 
 
 
261 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  44.53 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  41.7 
 
 
267 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3745  hypothetical protein  43.42 
 
 
262 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  32.36 
 
 
254 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  38.65 
 
 
261 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  32.54 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  43.09 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.92 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  37.19 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30.88 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  32.95 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  38.89 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0116  protein of unknown function DUF81  40.91 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32.95 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0129  hypothetical protein  41.08 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.998709  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0948  hypothetical protein  42.15 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2893  hypothetical protein  41.5 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  36.77 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  32.42 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  32.72 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.87 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  30.09 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.1 
 
 
2798 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.52 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  29.46 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2533  hypothetical protein  40.44 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  32.54 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  28.5 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28.82 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  28.02 
 
 
245 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  28.02 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  27.96 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  25.56 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.31 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  28.23 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  28.23 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  29.25 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  29.25 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  29.74 
 
 
255 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  27.68 
 
 
270 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  30.64 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  32.74 
 
 
260 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  30.07 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  27.93 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.31 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2078  permeases-like protein  47.83 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.46 
 
 
266 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  30.18 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  30.18 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  35.78 
 
 
121 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.01 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.27 
 
 
263 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  25.5 
 
 
415 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  30.18 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.81 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  30.59 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  30.99 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  26.07 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.64 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.83 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  26.62 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>