281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3831 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  87.84 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  52.29 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  52.86 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  51.8 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  49.3 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  51.8 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  51.14 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  49.77 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  47.39 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  47.73 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  46.53 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  47.58 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  47.18 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  43.72 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  45.71 
 
 		 254 aa  175  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  51.2 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  50.24 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  41.26 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  42.53 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  42.08 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  39.09 
 
 		 244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  32.88 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.36 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  21.59 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.11 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.59 
 
 		 2798 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  24.87 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.84 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.27 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  31.25 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  25.73 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  26.45 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  32.41 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  31.18 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  25.34 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  24.63 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  24.22 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.46 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  39.09 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.63 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.29 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.27 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.29 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  39.83 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  32 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.68 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  25.62 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  36.75 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  30.57 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.91 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  25.28 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  26.27 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.39 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.2 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  24.81 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  29.77 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  24.51 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.34 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  40.91 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  24.34 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  28.9 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  32.35 
 
 		 117 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  21.17 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  27.73 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  23.96 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  26.91 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  27.88 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  25.65 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  30.65 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.07 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  30.04 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  22.07 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  25.59 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  30.3 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.34 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  28.09 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  28.51 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  29.55 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>