149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3994 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  74.7 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  74.7 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  73.81 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  65.46 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  66.39 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  60.83 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  63.64 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  63.64 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  44.39 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  45.38 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  43.9 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  45.24 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  41.28 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  44.75 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  44.8 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  40.36 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  40.36 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  41.36 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  36.65 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  30.86 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.96 
 
 		 2798 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  29.43 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.68 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.98 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.64 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  24 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.6 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  29.26 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  32.73 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  30.74 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  30.74 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.97 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  30.32 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.84 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  30.29 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  32.94 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  25.94 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  32.35 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.35 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.94 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.48 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.22 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.87 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  36.44 
 
 		 121 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 354 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  26.67 
 
 		 117 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  29.94 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  25.35 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  29.94 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.68 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.95 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  25.81 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.23 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.39 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.27 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.71 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.2 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  24.41 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  24.53 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  33.96 
 
 		 120 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  39.47 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  21.67 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  31.78 
 
 		 123 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  27.48 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  25.78 
 
 		 308 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  28.84 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.32 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  26.48 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.79 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.4 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.59 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  24.27 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  24.64 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  21.47 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  25 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  34.29 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  21.08 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  32.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  37.23 
 
 		 119 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  26.9 
 
 		 275 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  29.06 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  31.07 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  23.28 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>