142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2132 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  72.02 
 
 		 261 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  72.48 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  70.78 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  70.78 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  70.37 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  68.33 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  66.97 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  61.82 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  65.82 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  65.4 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  48.56 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  46.34 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  44.29 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  45.41 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  44.28 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  41.15 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  43.78 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  41.55 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  41.55 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  42.08 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  40.85 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.78 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  27.69 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  25.5 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  27.93 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.71 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  35.4 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.12 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.93 
 
 		 123 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  33.96 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.99 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1844  hypothetical protein  29.71 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.79 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  20.6 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  26.04 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  29.92 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  33.65 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.21 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  27.09 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  28.57 
 
 		 117 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.94 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  25.98 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.82 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  24.88 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  30.14 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.63 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  28.79 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  28.12 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  28.12 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  22.55 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  40.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  25.11 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  26.51 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  38.1 
 
 		 123 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  27.65 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  28.85 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.37 
 
 		 2798 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  24.76 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  29.08 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  23.17 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.36 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  21.69 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  26.42 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25.53 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  22.31 
 
 		 265 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  44.78 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1057  hypothetical protein  36.73 
 
 		 125 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  hitchhiker  0.0000933375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  25.24 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.07 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.5 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  22.06 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  32.41 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  31.88 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.46 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  28.68 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  27.87 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  32.35 
 
 		 120 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  22.31 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  25.19 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  22.56 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  26.42 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  26.76 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  26.76 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  29.17 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2767  hypothetical protein  32.03 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  24.43 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>