130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2848 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  45.66 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  40.83 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  43.16 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  43.16 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  43.4 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  42.74 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  42.58 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  36.49 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  36.12 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  39.55 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  36.89 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  39.09 
 
 		 277 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  35.58 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  35.91 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  35.91 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  39.37 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  41.55 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  42.11 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.91 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.91 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.96 
 
 		 2798 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  34.21 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.38 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.23 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.9 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  27.45 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  31.18 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  31.16 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  29.3 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  26.75 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.52 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.32 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.32 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  24.42 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  26.91 
 
 		 294 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  23.32 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  33.68 
 
 		 120 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  24.21 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.72 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.91 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  24.79 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  25.7 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  24.79 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  28.64 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  24.19 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  25.9 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  29.8 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  25.34 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.12 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  25.94 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.21 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  25.59 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  28.97 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.48 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.95 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  23.16 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  33.94 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  27.81 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  23.38 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1259  hypothetical protein  23.88 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.61 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  35.05 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  23.28 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  27.88 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  33.65 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5037  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  0.114228 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.36 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  29.5 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2766  membrane protein  35.63 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.094222  decreased coverage  0.00946421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  27.91 
 
 		 127 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  36.14 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  40 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  28.18 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  30.1 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  24.07 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.4 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  35.45 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>