171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8368 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
244 aa  447  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  60.87 
 
 
249 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  34.96 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  33.48 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  29.84 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.03 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  28.4 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.07 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  29.41 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  32.06 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.61 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.46 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  27.49 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.58 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  24.23 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  24.06 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  26.67 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.63 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  29.03 
 
 
282 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.79 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  26.46 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  25.27 
 
 
274 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  26.97 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  26.82 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  24.66 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  29.79 
 
 
300 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  26.39 
 
 
272 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  26.82 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  27.93 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  29.41 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27.97 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  26.17 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  26.63 
 
 
343 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  28.31 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  24.76 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  28.04 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  27.78 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  27.78 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  26.92 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  27.35 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25.67 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4544  hypothetical protein  35.55 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.63 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  25.67 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  25.79 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  26.61 
 
 
270 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  30.94 
 
 
261 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  27.35 
 
 
262 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  26.7 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26.54 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  23.83 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  26.03 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  28.38 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  26.55 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  30.52 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.21 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  26.23 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  30.38 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  24.76 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  25.32 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.79 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  29.63 
 
 
119 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  37.04 
 
 
2798 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  29.37 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  27.75 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  32.35 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.65 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  25.1 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  28.17 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  28.98 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  31.12 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  29.37 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  28.45 
 
 
121 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  23.33 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  28.85 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  25.33 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  33.06 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  25.35 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>