165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3729 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  83.52 
 
 
261 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  81.99 
 
 
266 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  77.78 
 
 
261 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  77.39 
 
 
261 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  77.78 
 
 
261 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  77.01 
 
 
261 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  63.42 
 
 
260 aa  305  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  58.62 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  55.77 
 
 
260 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  53.61 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  54.98 
 
 
262 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  46.22 
 
 
253 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  45.11 
 
 
289 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  53.39 
 
 
264 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  53.39 
 
 
262 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  53.39 
 
 
262 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  53.39 
 
 
262 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  53.39 
 
 
262 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  53.39 
 
 
262 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  53.39 
 
 
262 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  45.02 
 
 
256 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  53.44 
 
 
262 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  53.38 
 
 
262 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  52.65 
 
 
262 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  52.29 
 
 
262 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  53.57 
 
 
264 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  45.77 
 
 
255 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  52.4 
 
 
262 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  48.05 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  51.39 
 
 
262 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  51.79 
 
 
262 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  53.65 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  53.65 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  53.22 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  43.13 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  46.79 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  47.41 
 
 
262 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  48.06 
 
 
263 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  42.31 
 
 
264 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  43.72 
 
 
253 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  47.01 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  46.51 
 
 
263 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  44.09 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  38.13 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  37.93 
 
 
257 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  42.05 
 
 
261 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  41.13 
 
 
257 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  40.26 
 
 
257 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  43.72 
 
 
257 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  38.4 
 
 
257 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 
309 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  46.7 
 
 
256 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  40.95 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  33.59 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 
309 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  34.36 
 
 
323 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  34.38 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  35.14 
 
 
317 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  35.98 
 
 
269 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  34.63 
 
 
332 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  31.35 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  35.57 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  31.6 
 
 
263 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.85 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  45.61 
 
 
131 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  43.12 
 
 
119 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  29.23 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  30.35 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.62 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.61 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.92 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.73 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.01 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.28 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.09 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.09 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.14 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.97 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.01 
 
 
296 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.01 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  26.37 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.31 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  26.85 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.5 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.77 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.83 
 
 
307 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.27 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  42.5 
 
 
307 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 
307 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.24 
 
 
304 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  25.36 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>