38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2148 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  690    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  52.2 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  44.44 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  43.06 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  30.8 
 
 		 248 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  28.64 
 
 		 220 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  23.89 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  25.55 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  24.02 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  25.21 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.35 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  25.73 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  26.79 
 
 		 244 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  23.53 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  23.21 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  36.63 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  25.87 
 
 		 257 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  26.14 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  26.36 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  26.36 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  26.36 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  28.26 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  28.99 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  30.19 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.23 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  24.06 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  33.04 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  25.37 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  24.04 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  24.04 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  28.47 
 
 		 257 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  23.24 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  23.24 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1650  hypothetical protein  24.5 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>